Ідея сітки та крапки давня. Середньовічні джерела описують шифри, побудовані з частин хреста, а 1531 року Корнелій Агрипа описав ранню форму того, що пізніші автори назвали шифром розкрусіанців — одну сітку з дев'яти «клітин», де позиції крапки несуть алфавіт. Він приписував її юдейській кабалістичній традиції — «Кабалі Дев'яти Камер», де вона слугувала релігійній символіці більше, ніж таємниці.
Слава шифру приходить з масонства. Ложі вживали «свинюшку» з початку XVIII століття, щоб тримати приватними записи історії та обрядів і для листування між керівниками лож — так завзято, що систему нині просто звуть «шифром масонів». Вона висічена там, де й слід очікувати: на масонських надгробках трапляються гравіювання «свинюшкою», і один із найдавніших каменів цвинтаря церкви Трійці в Нью-Йорку читається «Remember death» — масонське memento mori.
7 липня 1730 року французький пірат Олівє Левассер нібито кинув у натовп клаптик паперу з «свинюшкою» на власній екзекуції — нібито з показом місця свого ніколи не знайденого скарбу. Послання так і не прочитали рішуче, а точне розташування його сітки померло з ним: ранній урок — нестандартний варіант змушує до справжнього криптоаналізу. Під час Громадянської війни в США полонені півночі у в'язницях півдня вживали «свинюшку», щоб передавати повідомлення повз увагу наглядачів, а документація армії Джорджа Вашингтона показує версію системи з перемішаним алфавітом.
Сайти охоче приписують варіант із хрестами-променями середньовічним тамплієрам. Наукове джерело самого «шифру тамплієрів» каже інше: система з роздвоєним алфавітом і хрестами — праця нео-тамплієрів масонів XVIII століття, а не релігійного ордену XII–XIV століть. Середньовічний орден такий шифр не залинив; легенда — сучасна маркувальна обгортка на старій ідеї.
Шифр вижив, ставши грою. Він з'являється в дитячих книжках про таємне письмо, квестах, ескейп-кімнатах, скарбницькому фікшні від Верна, і навіть у щоденнику австралійського поселенця 1852 року, який історики розглянули два століття потому. «Свинюшка» нічого не захищає — вона сигналізує таємницю, а це, можливо, найдовговічніша робота, яку може мати шифр.